Проект был взаимоувязан по очень большому числу факторов. Бездумное нарушение и отход от проекта, неминуемо повлечет нарушение в работе всей системы отопления. Потому, что вся армутура, диаметры труб, и возможно установленные в подвале дроссельные шайбы (или автоматические регуляторы расхода) были просчитаны проектировщиком именно так, как было им и указано в проекте. Отступления неминуемо потребуют перепросчета проекта, и возможно изменения диаметров труб, а дроссельных шайб - онозначно.
Попытайтесь, каким-либо образом, заставить подрядчика, сделать по проекту. Или нужно будет сделать новый проект с учетом отсутствующего стояка. И уже переделать сделанное в соответствии с новым проектом. Хотя бы сделать аудит. Могу сделать Вам аудит Вашего существующего отопления. С выдачей рекомендаций по возвращению системы в исправно функционирующее состояние.