попробуйте промыть дроссельный узел любой промывкой для карбюратора в баллонах. для этого,правда, нужно снять весь дроссельный узел(вместе,кстати,с РХХ). если не поможет,а навыков поиска неисправностей нет-к диагносту!
а если проблема возникла после отсоединения АКБ то скорее всего сбились таблицы самообучения. дайте машине поработать на ХХ в течении 15-20 минут. промывка,правда,не помешает.
П.С. у Вас сигнализация,случайно,не отключает главное реле сразу после остановки мотора?
чтобы это определить,нужно послушать поведение этого самого РХХ сразу после остановки мотора-он должен еще некоторое время жужжать,калибруясь заново и стряхивая с себя различный возможный мусор(жужжит он слабенько,так что слушать внимательно надо). если же он молчит как партизан-то это значит,что при следующем пуске возникнут проблемы с калибровками. лечится переустановкой сигнализации и битьем морды установщику.