Общее правило - в расчет берется момент сопротивления относительно той оси, вокруг которой действует изгибающий момент.
Ну, общепринято, что х - горизонтальная ось, у - вертикальная. Если ваш уголок лежит горизонтально, на него действует вертикальная нагрузка, вызывающая изгиб его в вертикальной же плоскости, то изгибающий момент действует вокруг горизонтальной оси, и в расчет берется Wx - момент сопротивления относительно горизонтальной оси.
Для равнополочного уголка его ориентация при этом неважна (если только он не лежит вообще косо), а для неравнополочного нужно смотреть, чтобы его положение при этом соответствовало тому, которое нарисовано в справочной таблице. В противном случае Wx и Wy меняются местами.
Если положить уголок "домиком" - углом вверх, а полками в стороны вниз, то вообще ни Wx ни Wy не помогут - надо вычислять момент сопротивления относительно новой, неортогональной оси.
Вообще говоря, моменты инерции и моменты сопротивления прокатных профилей в справочниках даются не относительно "вертикали" или "горизонтали", а относительно характерных осей сечения. Ведь в реальности профиль можно положить по-разному, и его, к примеру, бОльшая полка может оказаться параллельна либо вертикали, либо горизонтали, либо вообще под углом.
К тому же основыне нагрузки на стройконструкции - от собственных весов, они вертикальны. Но бывают же нагрузки и горизонтальные, и направленные под углом к горизонту.
Трудно как-то это на пальцах объяснять. Чтобы понимать это дело в принципе, нужен сопромат и строительная механика. А если понимание не требуется, то нужно искать в справочнике пример расчета, близкий к вашему конкретному случаю, и по нему действовать.