трещина, скорее всего при укладке, т.к. многие укладчики, считают, что линолеум это все что на полу. 
натуралка, это дерево с маслом и смолой ("некоторым" укладчикам кажется, что это брак, что он пересох и полная фигня) при "желании сильно завернуть, он трескается, сначала этой трещины не видно, но стоит пару раз попасть грязной воде, и она видна отчетливо.
можно запросто вылечить.
швы, надо смотреть, может быть так, что пожгли края у покрытия (вдоль шва, на покрытии черные "окантовки" особенно на светлом), с эти несколько сложнее, необходимо шов расшить чуть шире, а в этом случае м.б. понадобиться варить в два шнура (т.е. шов стане несколько толще, не 3,8 мм как обычно, а 5-6) но это тоже не проблема.
с пятнами, надо смотреть, линолеум (лино- лен; ойл- масло), масло боиться высокой концентрации щелочи, т.е. после очистки щелочными средствами, нужно собрать грязь, и промыть холодной водой (нейтрализовать), такое может быть если по покрытию топтались ногами испачканными в цементе.
со временем пока не понятно как, а так в принципе могу помочь справиться.
швы пачкаются, т.к. это термоклей, но швы покрывают мастикой (обычно продается вместе с бабиной шнура), или нанести (после очистки покрытия) по всей поверхности, мастики бывают матовые и глянцевые.
было бы не плохо фотографии.