Что за полости под крышей на торце 5-этажки

См. фото. Думаю - это может быть какая то вентиляция перекрытий крыши. Вопрос на предмет можно ли их замуровать? При косом дожде вода вроде через них течет по шву, да еще голуби там сидят и гадят на подоконник... Птичий грипп однако где-то рядом уже... Может кто-нибудь заделывал это безобразие и как?

вентиляция, вроде. От дождя козырёк сделай, от голубей воздушка...

Без "вроде" ;). Это вентиляция чердачного пространства. Конструкция "холодный чердак". Чтобы конденсат не скапливался под кровлей, т.е. чтобы конструкции не гнили, не ржавели.

Нарушение температурного и влажностного режима чревато увлажнением теплоизоляции и конструкций, и как следствие – потеря прочностных и утеплительных свойств, нарушение несущей конструкции вплоть до ее обрушения.

http://acadomia.ru/articles/svoy-dom-nachalo/the-condensate-in-the-attic/