выписывали счёт на предоплату ВМЕСТЕ с суммой за доставку (300руб.)
Видимо имеется в виду доставка от офиса проадавца до офиса трансп.компании. А вторые 300 вы платили уже за доставку от офиса трансп.компании в городе М.до офиса трансп.компании в городе X. Вообще то это не нормально потому как есть такие кто не берут в этом случае за 1 этап доставки.