Если вы опасаетесь, что будет "стекать" химия, то масляная краска и олифа тоже нехорошо. Там есть сиккативы (ускорители высыхания), содержащие кобальт, марганец и др.
Воспользуйтесь чистым льняным маслом. Натур продукт 100%. У Тиккурилы есть под названием Саунапеесо кажется. В названии точно не уверен - спросите у продавцов масло для полок в саунах - они подскажут.
Но, честно говоря, опасаться особо нечего. В высохшем покрытии все вредные вещества находятся в связаном и трудновымываемом состоянии. Из почвы в воду больше дряни лезет, чем может стекать с крышки колодца, покрашенной Пинотексом.