СЛТ написал :
я мыслю заполнить с припуском пустоты герметиком, а потом когда высохнет излишки срезать сапожным ножом
Для этого вам "твердый" герметик не нужен. Самый обычный силиконовый обеспечит жесткость с большим запасом, надо его только продавить вглубь. У вас же площадь контакта очень большая. Чтобы понять - проведите простой эксперимент. Возьмите лист резины. В любой точке вы сможете ее продавить пальцами, она эластичная. А теперь положите резину на гладкую жесткую поверхность, накройте сверху так же жесткой поверхностью (например, плиткой, или стальным листом), и попытайтесь продавить. У вас это не получится, даже если встанете сверху ногами.
Проще всего в вашем случае все же открутить унитаз, приподнять его на 2-3 см, нанести герметик, и поставить на место. Это все можно сделать даже без отсоединения унитаза от канализации и водопровода. В противном случае трудно будет добиться затекания герметика по всей площади.
Что касается эпоксидной смолы - тоже можно, но держать будет плохо. Вы ведь не сможете зачистить поверхности. Она к ним не прилипнет толком, и довольно быстро развалится на куски, как это уже сделала строительная смесь.