Грэй написал : Я тоже полагаю что пятна - из-за неравномерной впитываетмости.
А мне кажется пятна у вас не из-за этого. Скорее всего это неоднородность фактуры поверхности. Что понятнее было - пример. На покрашенном потолке пошлифуйте небольшой участок и покрасте полностью ещё одним слоем. На месте шлифовки появиться пятно. Если не хотите шпаклевать, вариант один - создать рельефную покраску, так называемую "шагрень". Получить её можно или очень густой краской мякким валиком (или специальным валиком), или краскопультом, густота краски должна быть подобрана на пределе возможности краскопульта, покраска должна производиться с большого расстоятия - 0,7 - 1,0м, несколько раз. Сразу предупреждаю - при иаком варианте расход краски заметно увеличивается.