Если исходить из объема перемещаемой жидкости в 1 см3 то получается диафрагма будет иметь диаметр в 50 мм и ход 2 мм. От насоса к объекту идет шланг диаметром совместимый с диаметрами шлангов капельницы т.е порядка 3 мм. Учитывая перепад сечений диафрагмы и шланга, что шланг такого сечения работает как дроссель, кавитация скорее возникнет недалеко от насоса. Видимо поэтому и требуется плавное нарастание давления. Поэтому скорее нужно не диафрагменный насос а плунжерный, т.е. аналог шприца небольшого диаметра.
Стерильность обеспечивается полной разборкой насоса с последующим кипячением или достаточно дезинфицирующей жидкости внутрь? От этого весьма зависит материал рабочей части насоса. Регулярную разборку насосы вряд ли выдержат, остается применить роликовый насос по рекомендации Medtech, там меняется только трубка. К нему придется ваять пару концевиков и реле для реверса потока.