Ну так проклейте пробку только со стороны плитки, а парктеной доской ее просто придавите. Потом аккуратно срежте ножом выступающую часть (доска-то у Вас небось 14мм, пробка стандарт 15 и 22мм.). Если цвет будет сильно контрастировать с паркетдоской, пропитайте пробку чем-то типа Пинотекса. И все. А паркетдоску, кстати, иногда вообще клеят на основание, какое уж там "плавание"...