Силикон (любой) в щели со временем потемнеет, будет грязный неряшливый ободок, который не убрать по простому. Думаю, маловероятно, что при уборе кто нибудь станет тщательно вытирать влагу и грязь с контура подошвы прибора.
Да и мало-ли, ещё понадобится унитаз демонтировать, например, трубу какую нибудь заменить за ним, а у нас прибор приклеен, да ещё и намертво, так, что при попытке его расшатать будет реальная возможность оторвать (плохо приклеенную) плитку или его расколоть. То есть, если мазать силиконом подошву с целью герметизации, то только тонкой полоской. Но, часто эта самая подошва бывает не совсем плоская, даже у брендов. В этом случае, тонкого слоя силикона может не хватить и горшок будет качаться. Поэтому, я ставлю унитаз на линолеум, притягиваю штатным крепежом.