C пробкой ничего не случится, а вот плесень или грибок там за милую душу заведется. Кроме того, что какое-то время пол будет чуть холоднее, пока не высохнет, вы ничего не заметите. Но вот когда под линолеумом заведется жизнь и разум там выросший выйдет с вами пообщаться, будет неприятно. Лучше вскрывать и сушить.