Все зависит от того, что будет потом на фанере. Если паркет, тогда лучше ничего не наносить, что слабое на разрыв. Лучше бы шлифовать, стык пу герметиком, а если линолеум на долго оставлять, и потом что то плавающим способом, тогда пройтись шпатлевкой, например Форбо 900, эластичная и барьер для миграции пластификаторов (это если не клеить потом штучку или массив)