Я бы лазерным нивелиром поставил 4 марки по углам, по ним натёр бы маяки из цпс, и по этим маякам правилом либо наливной, либо плиточным клеем. Но вы уже залили гипсовый, и наверное им и заканчивать в вашем случае. Если бугор не пролезет под правилом- сбить. Если высота стяжки не критична- самую высокую точку принять за ноль.