Нужна схема балансировки, которая отслеживает напряжение на каждой ячейке, в Вашем случае на каждой батарее, а также при заряде уменьшает ток через ячейку, в случае, если напряжение на ней превышает допустимое. Это сделать можно 2-мя способами:
при превышении напряжения на ячейке она шунтируется источником напряжения, через который протекает "лишний" ток, либо ячейка "закорачивается", а сама отключается напрочь. Первый способ проще, но менее экономичный (часть энергии нагревает улицу:)), второй сложнее схемотехнически
Такой способ серьезно "продлевает жизнь" аккумуляторам, а с точки зрения цены, окупается еще на первом комплекте аккумуляторов. Если делать самому, то цена комплектухи дешевле одного аккумулятора, но требуются трудозатраты.
Также нужно отключать батарею целиком при понижении напряжения ниже, чем положено на любой из ячеек, либо только разраженную ячейку (что гораздо сложнее :( ), это при разряде.